Mathieu Ganio est le fils de Dominique Khalfouni, ancienne Étoile du Ballet de l'Opéra national de Paris devenue soliste du Ballet national de Marseille de Roland Petit, et de Denis Ganio, lui aussi soliste du Ballet national de Marseille. En 1986, sa première apparition sur scène eu lieu lorsqu’il avait deux ans, aux côtés de sa mère, lors de la création du ballet de Roland Petit Ma Pavlova. Mathieu Ganio et sa sœur cadette Marine Ganio, aujourd'hui Sujet dans le corps de ballet de l'Opéra national de Paris, accompagnent alors leurs parents dans les tournées du Ballet de Roland Petit. 

Mathieu Ganio commence l'apprentissage de la danse à l'âge de sept ans, au Studio Ballet dirigé par Colette Armand, mère du danseur Patrick Armand. 

De 1992 à 1999, il poursuit sa formation à l'École nationale supérieure de Danse de Marseille. 

En 1999, Mathieu Ganio intègre l'École de danse de l'Opéra national de Paris en seconde division. Il interprète le rôle de Franz dans Coppélia lors de sa représentation de fin d'année en 2001.

Engagé en 2001, dans le corps de ballet de l'Opéra national de Paris, il est promu Coryphée en 2002 et Sujet en 2003. 

Mathieu Ganio est nommé Étoile le 20 mai 2004, à l'âge de 20 ans, à l'issue d'une représentation de Don Quichotte, sans passer par le grade de premier danseur. Cette nomination fut une totale surprise puisqu'il ne devait pas danser ce rôle initialement.

Mathieu Ganio est Officier des Arts et Lettres, et a reçu le Prix Benois de la danse en 2005.  

Dans le cadre des tournées officielles du Ballet de l’Opéra, il se produit notamment : en Suisse (Genève, 2009), au Japon (Tokyo 2010, 2013 et 2020 / Nagoya, 2013), en Australie (Sydney, 2012), aux États-Unis (Chicago / Washington / New York, 2012), en Malaisie (Singapour, 2012), et aux Émirats Arabes Unis (Abou Dhabi, 2019).  

Langues parlées : français et anglais

Crédit photo : James Bort